すべての原点となった第1部／石仮面のルーツに迫る第2部
第1部『ファントムブラッド』の舞台は1880年代のイギリス。貴族の息子、ジョナサン・ジョースターの前にディオ・ブランドーという少年が現れたところから物語は始まる。野心家のディオはジョースター家を乗っ取ろうと画策するが、ジョナサンは彼の企みを見抜き、計画を阻止。
するとディオは謎の古代遺物・石仮面の力で吸血鬼に変貌する。ジョナサンは、吸血鬼への対抗手段である「波紋」の呼吸を修得してディオに立ち向かう！
続く第2部『戦闘潮流』は、ジョナサンの孫、ジョセフ・ジョースターが主人公。ジョナサンとディオの戦いについて知らぬまま成長したジョセフは、1938年にイギリスからアメリカへと移住。時を同じくして、メキシコの奥地で大量の石仮面と謎の生命体「柱の男」が発見された。
その出来事をきっかけに石仮面の存在と自身の因縁を知ったジョセフは、祖父から受け継いだ波紋の力と持ち前の機転のよさを活かし、柱の男と戦う。
